Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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ITGB3BPQ13352 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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ITGB3BPQ13352 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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ITGB3BPQ13352 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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ITGB3BPQ13352 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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ITGB3BPQ13352 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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ITGB3BPQ13352 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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