Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC103808.6-201ENST00000578035 464 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL158151.4-201ENST00000600965 507 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SND1-IT1-201ENST00000623342 2481 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 BCL2L14-204ENST00000396367 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CEACAM6-201ENST00000199764 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TMPPE-202ENST00000416695 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AMYH02020865.1-201ENST00000621140 2591 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC087203.2-201ENST00000526502 1587 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 A2ML1-205ENST00000539547 3460 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ANKS1B-220ENST00000550693 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CFAP61-210ENST00000451767 1946 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL078621.1-201ENST00000272567 768 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SKP208-201ENST00000365474 361 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SL233P-201ENST00000469988 277 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC117395.3-201ENST00000471176 680 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms