Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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