Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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PGGT1BP53609 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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PGGT1BP53609 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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PGGT1BP53609 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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