Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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APAF1O14727 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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APAF1O14727 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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APAF1O14727 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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APAF1O14727 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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