Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms