Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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SH3BP1Q9Y3L3 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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SH3BP1Q9Y3L3 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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SH3BP1Q9Y3L3 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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SH3BP1Q9Y3L3 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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SH3BP1Q9Y3L3 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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SH3BP1Q9Y3L3 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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