Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms