Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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