Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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COL24A1Q17RW2 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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COL24A1Q17RW2 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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COL24A1Q17RW2 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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COL24A1Q17RW2 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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COL24A1Q17RW2 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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COL24A1Q17RW2 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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