Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.1 ms