Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms