Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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