Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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SEMA3BQ13214 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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SEMA3BQ13214 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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SEMA3BQ13214 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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SEMA3BQ13214 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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SEMA3BQ13214 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3BQ13214 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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