Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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PGGT1BP53609 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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PGGT1BP53609 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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