Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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PTPRMP28827 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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PTPRMP28827 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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PTPRMP28827 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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PTPRMP28827 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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PTPRMP28827 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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PTPRMP28827 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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PTPRMP28827 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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