Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
POLR2AP24928 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms