Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CAGE1-208ENST00000512086 2537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF20-201ENST00000334213 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ERI2-215ENST00000569729 2646 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RGS7-202ENST00000366563 2206 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 U3.1-201ENST00000362500 215 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-11P-201ENST00000383975 164 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AAMDC-202ENST00000393427 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RPS6KA2-IT1-201ENST00000416770 579 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RBMY2GP-201ENST00000418671 1034 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC231533.2-201ENST00000419045 978 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RBMY2NP-201ENST00000434454 1028 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL136454.1-201ENST00000443181 466 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC004817.1-201ENST00000553621 721 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC068631.1-229ENST00000599314 739 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC138035.1-203ENST00000604354 1066 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC087623.4-201ENST00000606593 695 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC244196.3-201ENST00000614171 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms