Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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USP29Q9HBJ7 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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USP29Q9HBJ7 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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USP29Q9HBJ7 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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