Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DCLK3Q9C098 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms