Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 EEF1A1P5-201ENST00000436459 1389 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 OR6M3P-201ENST00000531567 700 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC243830.2-201ENST00000618067 630 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCG3Q8WXD2 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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