Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC009269.1-203ENST00000496414 828 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC02296-201ENST00000557070 544 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR10G8-202ENST00000641224 1033 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR5AU1-204ENST00000641822 1197 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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VAMP3Q15836 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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VAMP3Q15836 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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VAMP3Q15836 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC090954.1-201ENST00000445502 361 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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VAMP3Q15836 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC02162-201ENST00000512521 574 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 IGKV2OR22-4-201ENST00000523309 367 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC064807.3-201ENST00000523810 470 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC022796.1-202ENST00000531882 477 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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