Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms