Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1Q14C86 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1Q14C86 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1Q14C86 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1Q14C86 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1Q14C86 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1Q14C86 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1Q14C86 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1Q14C86 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1Q14C86 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
GAPVD1Q14C86 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
GAPVD1Q14C86 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1Q14C86 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
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