Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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CHD4Q14839 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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CHD4Q14839 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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CHD4Q14839 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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CHD4Q14839 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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CHD4Q14839 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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CHD4Q14839 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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CHD4Q14839 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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