Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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COL4A6Q14031 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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COL4A6Q14031 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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COL4A6Q14031 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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