Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms