Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms