Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
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FOXE3Q13461 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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FOXE3Q13461 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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FOXE3Q13461 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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