Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms