Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MAP7D3-203ENST00000370661 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 OR9I1-202ENST00000641439 3184 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MAGI1-IT1-201ENST00000460754 2567 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AMPH-201ENST00000325590 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC063949.2-201ENST00000508671 1968 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ADGRF4-203ENST00000371220 3075 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MTRF1-202ENST00000379477 1948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ARNT-208ENST00000505755 2427 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 OR8D4-202ENST00000641687 2904 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LRRC8D-202ENST00000394593 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 GH2-202ENST00000423893 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 Z98752.2-201ENST00000432727 312 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC234782.3-201ENST00000461229 433 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 AC008581.1-201ENST00000512650 385 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC126177.6-201ENST00000550420 1009 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 IKZF3-217ENST00000623724 9787 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 SERPINB2-201ENST00000299502 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 GCNT1P5-201ENST00000449274 682 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC117395.3-201ENST00000471176 680 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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