Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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FOXF2Q12947 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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