Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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PGGT1BP53609 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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PGGT1BP53609 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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PGGT1BP53609 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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