Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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