Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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PTPRAP18433 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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PTPRAP18433 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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PTPRAP18433 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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PTPRAP18433 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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PTPRAP18433 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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