Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ERVV-1B6SEH8 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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