Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLDN19Q8N6F1 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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