Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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NRF1Q16656 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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NRF1Q16656 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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NRF1Q16656 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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NRF1Q16656 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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NRF1Q16656 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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NRF1Q16656 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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NRF1Q16656 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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