Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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