Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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PDCD1Q15116 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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PDCD1Q15116 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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PDCD1Q15116 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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PDCD1Q15116 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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PDCD1Q15116 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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PDCD1Q15116 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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PDCD1Q15116 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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