Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NFIXQ14938 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms