Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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