Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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