Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MTND6P19-201ENST00000519399 524 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 COX4I1P1-201ENST00000554239 509 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 7SK.12-201ENST00000612820 244 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC243830.2-201ENST00000618067 630 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MS4A10-201ENST00000308287 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MPEG1-201ENST00000361050 4442 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PDIK1L-201ENST00000374269 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LY75-CD302-202ENST00000505052 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 EPB41L5-202ENST00000331393 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ODF2-220ENST00000604420 3030 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC016747.1-201ENST00000420918 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL355607.1-201ENST00000427745 295 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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CLN3Q13286 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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CLN3Q13286 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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CLN3Q13286 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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CLN3Q13286 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC104083.1-201ENST00000569449 2615 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MAPK10-329ENST00000641555 2656 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ARHGAP1-201ENST00000311956 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 STXBP5-AS1-209ENST00000606831 2025 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CDH18-201ENST00000274170 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CDH18-203ENST00000502796 2386 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TNFAIP8-204ENST00000503646 2502 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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