Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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CALD1Q05682 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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CALD1Q05682 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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CALD1Q05682 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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CALD1Q05682 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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CALD1Q05682 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CALD1Q05682 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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