Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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