Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXC13P31276 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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HOXC13P31276 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXC13P31276 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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