Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXA3O43365 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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