Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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