Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms